Équipements scientifiques :

Afin de proposer à ses partenaires des ressources technologiques de haut niveau, BIOASTER s’est doté d’instruments scientifiques à la pointe des dernières innovations. Ces instruments font l’objet d’activités de recherche (incrémentale ou de rupture), qui font en permanence évoluer l’offre technologique, en la maintenant à l’état de l’art.

Parmi les instruments emblématiques mis en place dans le domaine des « omiques », citons :

  • Séquenceurs de nouvelle génération (2ème génération : MiSeq et NextSeq500 Illumina, Proton et PGM Life Technologies ; 3ème génération : MinION Oxford Nanopore) et plateformes de quantification d’ADN et d’ARN moyen-débit (nCounter Nanostring, Biomark Fluidigm, RainDrop Digital PCR RainDance Technologies),
  • Spectromètre RMN 600 MHz Bruker avec cryosonde (1H/13C/31P) et passeur automatique d’échantillons,
  • Spectromètres de masse pour analyse à haute résolution (Q-TOF maXis HD Bruker, Orbitrap Q ExactiveThermoScientific) ou quantitative (TripleQuad ThermoScientific, QTRAP 5500 Sciex) ou diagnostique (VITEK MS BioMérieux).
  • Cytomètre de masse (CyTOF 2, DVS / Fluidigm), microfluidique en gouttes, immuno-essais ultrasensibles (Simoa Quanterix)
  • Plateformes automatisées de préparation de l‘échantillon et d’extraction des analytes (Tecan freedom evo)

La gestion et l’analyse multi-dimensionnelle de l’ensemble de ces données massives et hétérogènes s’appuient sur une infrastructure flexible, redimensionnable et de très haute performance, hébergée dans un data center du CNRS (Centre de Calcul de l’Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules, CC-IN2P3).

Spectromètre de masse pour analyse à haute résolution (Q-TOF Maxis HD Bruker)

Spectromètre de masse pour analyse à haute résolution (Q-TOF Maxis HD Bruker)

Trieur BD FACSAria II sous PSM

Trieur BD FACSAria II sous PSM

Spectromètre RMN 600 MHz Bruker avec cryosonde (1H/13C/31P)

Spectromètre RMN 600 MHz Bruker avec cryosonde (1H/13C/31P)

Chambre Anaérobie

Chambre Anaérobie

Triple Quadrupole couplé à système UHPLC

Triple Quadrupole couplé à système UHPLC

Orbitrap couplé à système UHPLC

Orbitrap couplé à système UHPLC

Équipements informatiques :

BIOASTER dispose grâce à son Service Informatique d’une infrastructure propriétaire, récente et robuste.

Elle est hébergée dans son bâtiment lyonnais mais aussi au Centre de Calcul de l’IN2P3 sur le Campus de la Doua de Villeurbanne et courant 2016 à l’Institut Pasteur de Paris. Tous ces éléments ont pour objectif de garantir la sécurité et la redondance de données scientifiques de BIOASTER et celles partagées avec ses partenaires.

L’ensemble de ces équipements informatiques sont principalement au service de l’innovation Technologique en répondant aux problématiques de capacité de stockage, disponibilité de mémoire, vitesse de calcul et rapidité de transfert.

L’infrastructure BIOASTER est ainsi conçue pour le travail collaboratif avec l’ensemble de ses partenaires privés et académiques grâce à des outils permettant le partage, le dialogue, le transfert, l’interopérabilité et la gestion mutualisée de ses systèmes et de ses données, tout en garantissant un cloisonnement absolu entre les projets réalisés dans son écosystème.

Les outils développés permettent aussi aux scientifiques de travailler en mode hébergé dans son bâtiment ou externalisé dans d’autres structures.

Enfin, l’architecture déployée se veut agile car évolutive, basée sur la virtualisation de ses ressources et administrée par une équipe à la fois spécialisée, réactive et au service des partenariats.

Schema équipements