Pôle technologique omics

Des innovations dans les technologies omiques orientées solution

LES ENJEUX

L’accès à des technologies omiques à l’état de l’art et intégrées, ainsi qu’à l’expertise associée, est indispensable à la recherche de nouveaux antimicrobiens ou vaccins, à la compréhension des relations hôte/microbiote, ou à l’identification de biomarqueurs. De plus, il est nécessaire de développer des réponses adaptées aux besoins et processus industriels, en terme d’innovation, qualité et/ou débit. Dans ce contexte, le Pôle Omics développe et implémente des innovations technologiques en Génomique et Transcriptomique, Métabolomique, Protéomique et Immunomonitoring, au sein des projets collaboratifs de BIOASTER.

OBJECTIFS

Proposer des approches omiques pour débloquer les verrous technologiques dans les projets collaboratifs de BIOASTER

  • Pour la compréhension des mécanismes biologiques (maladies, traitements, microbiote), en s’intéressant à la fois au microbe et à la réponse de l’hôte
  • Pour l’identification et la validation de biomarqueurs et signatures, à but de diagnostic ou de stratification
  • Avec le développement de technologies omiques, basé sur la recherche académique, avec un focus sur les besoins industriels

PROPOSITION DE VALEURS

SMART Omics

Schema Omics Propal Value

TECHNOLOGIES ET EXPERTISES

Génomique, Transcriptomique, Protéomique, Métabolomique, Immunomonitoring et Bioinformatique.

Schema Omics Expertises

RÉSEAUX & PARTENAIRES

Logo BD
Logo Bruker
Logo Promega
Logo Sciex
Logo Tecan

Highlights: Technologies designed by Bioaster

Met-SAMoA® for Metabolic Screening of Antimicrobial Mode of Action.

Expertises@BIOASTER SMART Omics

NOTES D’APPLICATION

  • OMICs Hub Metabolomics . Inter-individual heterogeneity in clinical metabolomics studies: Assessment of inter-individual NMR/MS metabolic signatures variability in plasma of a heterogeneous group of healthy volunteers – impact for biomarkers discovery.
    Voir la note d’application

Publications

  • Metagenomic Next-Generation Sequencing Reveals Individual Composition and Dynamics of Anelloviruses during Autologous Stem Cell Transplant Recipient Management. Bal A, Sarkozy C, Josset L, Cheynet V, Oriol G, Becker J, Vilchez G, Sesques P, Mallet F, Pachot A, Morfin F, Lina B, Salles G, Reynier F, Trouillet-Assant S, Brengel-Pesce K. Viruses. 2018 Nov 14;10(11). doi: 10.3390/v10110633.
  • A modular transcriptional signature identifies phenotypic heterogeneity of human tuberculosis infection. Singhania A, Verma R, Graham CM, Lee J, Tran T, Richardson M, Lecine P, Leissner P, Berry MPR, Wilkinson RJ, Kaiser K, Rodrigue M, Woltmann G, Haldar P, O’Garra A. Nat Commun. 2018 Jun 19;9(1):2308. doi: 10.1038/s41467-018-04579-w.
  • Type I interferon-mediated autoinflammation due to DNase II deficiency. Rodero MP, Tesser A, Bartok E, Rice GI, Della Mina E, Depp M, Beitz B, Bondet V, Cagnard N, Duffy D, Dussiot M, Frémond ML, Gattorno M, Guillem F, Kitabayashi N, Porcheray F, Rieux-Laucat F, Seabra L, Uggenti C, Volpi S, Zeef LAH, Alyanakian MA, Beltrand J, Bianco AM, Boddaert N, Brouzes C, Candon S, Caorsi R, Charbit M, Fabre M, Faletra F, Girard M, Harroche A, Hartmann E, Lasne D, Marcuzzi A, Neven B, Nitschke P, Pascreau T, Pastore S, Picard C, Picco P, Piscianz E, Polak M, Quartier P, Rabant M, Stocco G, Taddio A, Uettwiller F, Valencic E, Vozzi D, Hartmann G, Barchet W, Hermine O, Bader-Meunier B, Tommasini A, Crow YJ. Nat Commun. 2017 Dec 19;8(1):2176. doi: 10.1038/s41467-017-01932-3.
  • The REAnimation Low Immune Status Markers (REALISM) project: a protocol for broad characterisation and follow-up of injury-induced immunosuppression in intensive care unit (ICU) critically ill patients. Rol ML, Venet F, Rimmele T, Moucadel V, Cortez P, Quemeneur L, Gardiner D, Griffiths A, Pachot A, Textoris J, Monneret G; REALISM study group. BMJ Open. 2017 Jun 21;7(6):e015734. doi: 10.1136/bmjopen-2016-015734.