Unité Technologique
Microbiologie et ingénierie moléculaire

Concevoir et développer des solutions scientifiques et technologiques originales pour accélérer la recherche en microbiologie au profit de la santé animale et humaine.

Concevoir et développer des solutions scientifiques et technologiques originales pour accélérer la recherche microbiologique au profit de la santé animale et humaine.

Notre mission est de concevoir et développer des solutions scientifiques et technologiques originales pour accélérer la recherche microbiologique au bénéfice de la santé animale et humaine.

Nous apportons une expertise scientifique et technologique de pointe, de la conception à la conclusion d’un projet, dans les domaines de la génétique microbienne, de l’ingénierie des protéines, de la bactériologie (aérobie et anaérobie) et de la virologie.
L’Unité de Microbiologie réunit des experts en bactériologie, virologie, génétique et ingénierie des protéines pour faciliter la recherche microbiologique.

Biofilms

Défis

  • Les biofilms sont des communautés bactériennes complexes et multi-espèces qui vivent sur des surfaces biotiques et abiotiques.
  • Dans le domaine médical, les biofilms sont associés au grave problème des infections nosocomiales, notamment lorsqu’ils contaminent des dispositifs médicaux.
  • Dans le domaine médical, les biofilms sont associés au grave problème des infections nosocomiales, notamment lorsqu’ils contaminent des dispositifs médicaux.
    Les infections liées aux biofilms sont difficiles à traiter, en raison de la forte prévalence de la tolérance/résistance aux antibiotiques.
  • Il est nécessaire de concevoir de nouvelles stratégies de contrôle des biofilms, impliquant la prévention de leur formation sur les surfaces des dispositifs médicaux , en association avec des stratégies d’éradication.
  • Le criblage de médicaments anti-biofilm est complexe car leur formation est multifactorielle et l’établissement de conditions pertinentes de test représente un challenge.
  • Identifier les modes d’action des médicaments anti-biofilm.
  • L’optimisation des stratégies anti-biofilm en utilisant des combinaisons d’approches thérapeutiques, par exemple, des phages, des antibiotiques et des enzymes.

Nous pouvons évaluer de nouvelles stratégies anti-biofilm en utilisant des approches in vitro et/ou in vivo entièrement personnalisées.

Solutions

  • Concevoir de nouvelles stratégies pour la prévention de la formation de biofilms sur les surfaces.
  • Développer de nouvelles stratégies efficaces pour l’éradication des biofilm.
  • Concevoir et développer de nouveaux modèles d’infection par biofilm à utiliser in vitro.
  • Concevoir de nouvelles approches et technologies de dépistage pour permettre l’utilisation de solutions anti-biofilm chez les patients.
  • Tester de nouvelles approches anti-biofilm en utilisant des approches in vitro et/ou in vivo entièrement personnalisées.

Pourquoi BIOASTER ?

  • Nous utilisons une plateforme intégrée de caractérisation des biofilms (BIOFILM-ID),
  • Nous effectuons l’analyse des biofilms en utilisant des méthodes standardisées,
  • Nous travaillons avec des modèles statiques et dynamiques,
  • Nous concevons des approches de criblage sur mesure, en fonction de vos besoins,
  • Nous pouvons développer des modèles physiologiquement pertinents,
  • Nous pouvons travailler avec des pathogènes BSL-3,
  • Nous avons accès à une collection de micro-organismes d’origines diverses, par exemple, des échantillons cliniques, du microbiote intestinal et des souches résistantes aux antibiotiques.

Vidéos

Nous avons développé :

  • BiofilmCare,
  • Une approche multi-OMIC pour l’investigation du Mode d’Action (MoA) des anti-biofilms,
  • Des modèles in vivo.

Regardez la vidéo sur le biofilm ici.

Culturomics

Défis

  • Le microbiote intestinal joue un rôle important dans le maintien de la santé humaine, mais il est également impliqué dans le développement de maladies.
  • Les déséquilibres du microbiome, ou dysbiose, ont été associés à toute une série de maladies, dont certains types de cancer (par exemple le cancer du côlon), les maladies auto-immunes (par exemple la sclérose en plaques et le diabète de type 1), les maladies inflammatoires de l’intestin et même la dépression.

Aujourd’hui, l’étude du microbiote suscite un intérêt croissant, et dont l’un des objectifs est d’identifier ou de développer de nouveaux pré et probiotiques.

Solutions

  • La culture, l’identification et la caractérisation des bactéries qui peuplent l’intestin des humains et des animaux.
  • L’utilisation des techniques de culture, par exemple en utilisant des milieux anaérobies spécifiques dédiés aux bactéries intestinales difficiles à cultiver (par exemple F. prausnitzii et C. minuta).
  • L’identification de nouveaux antimicrobiens, issus du microbiote.
  • L’identification de biomarqueurs du microbiote intestinal comme indicateur de l’état de santé et moyen de prédiction de l’apparition future de pathologies.

Pourquoi BIOASTER ?

Nous utilisons la plateforme ANOXIC :

Il s’agit d’une plateforme intégrée pour l’isolement, la culture et la caractérisation de micro-organismes dans un environnement contrôlé (conditions aérobies ou anaérobies).

  • Elle combine l’utilisation d’un cytomètre en flux de haute précision de nouvelle génération, la sélection moléculaire des microorganismes (ex : anticorps ou marquage moléculaire), l’identification et la caractérisation moléculaire des microorganismes (NGS, séquençage complet 16S ou shotgun) et leur caractérisation phénotypique (ex : bactériocine, composés anti-inflammatoires ou production d’acides gras à chaîne courte).
  • Nous avons accès à une collection de micro-organismes d’origines diverses, dont des échantillons cliniques, des bactéries intestinales humaines et des souches résistantes aux antibiotiques.

Ingénierie des protéines

Défis

  • Le besoin de molécules complexes dans le développement de nouvelles stratégies cliniques, telles que de nouveaux vaccins, des outils de diagnostic et des systèmes d’administration de médicaments.
  • Le besoin d’approches personnalisées compatibles avec vos applications en aval.
  • Le besoin de tests fonctionnels, notamment de l’activité enzymatique.
  • Le besoin d’un accompagnement spécialisé et d’options personnalisables (par exemple, pour l’optimisation des codons et les procédures de purification des protéines).

Solutions

  • Des solutions intégrées pour l’expression, l’extraction et la purification de molécules complexes de qualité et dans des quantités appropriées, adaptées à la recherche pharmaceutique.
  • Une équipe expérimentée qui répond aux attentes des partenaires, de la conception des protéines à la caractérisation des produits.
  • Une série de vecteurs pour divers objectifs et applications spécifiques (par exemple, lipoprotéines, VLP, sécrétion).

Pourquoi BIOASTER ?

Nous disposons d’une plateforme intégrée et d’une expertise appropriée dans :

  • L’optimisation des systèmes d’expression (souches génétiquement optimisées et génération de bibliothèques de séquençage de transposons) ;
  • L’ingénierie des protéines (conception de protéines et systèmes de vectorisation, harmonisation des codons, clonage et criblage combinés, et optimisation de l’expression et de la purification) ;
  • Le développement d’outils analytiques (génération de ligands de novo, caractérisation biophysique et biochimique, caractérisation préclinique des lots, et caractérisation protéine-ligand).
WELSCH Jérémy
Jérémy WelschResponsable de l'unité Microbiologie et de Recherche PrécliniqueIcon email