Évaluez le mécanisme d’action, la réponse de l’hôte, l’activité, le profilage et l’efficacité de vos antimicrobiens pour alimenter un pipeline de nouveaux médicaments au bénéfice des patients.
Le besoin de nouveaux agents présentant une chimie et des modes d’action innovants pour lutter contre la menace que représente la résistance aux antimicrobiens est un enjeu majeur de santé publique. Ces dernières années, les progrès biologiques et technologiques ont ouvert la voie à une caractérisation plus précise des antimicrobiens.
Nous proposons à la fois des solutions sur mesure, mettant en œuvre des technologies innovantes et robustes, qui s’appuient sur des pratiques éprouvées en microbiologie pour évaluer le mécanisme d’action, la réponse de l’hôte, l’activité, le profilage et l’efficacité de vos antimicrobiens.
Évaluer la nouveauté du mécanisme d’action d’un antibiotique à l’aide d’une technologie sans marquage
Pour s’affranchir des technologies actuelles lourdes et fastidieuses (telles que les tests de criblage macromoléculaire ou divers tests nécessitant des produits marqués), nous avons développé des technologies sans marquage afin d’explorer le mécanisme d’action de vos nouveaux antibiotiques.
Nous sommes à même d’identifier rapidement si votre antibiotique dispose d’un mécanisme d’action qui se distinguerait de ceux des antibiotiques commercialisés, en combinant la métabolomique (voir ici la vidéo Met-SAMoA) ou l’optique holographique (consultez notre étude de cas HoloMoA ici) à l’intelligence artificielle. En disposant ainsi d’un indice solide sur un possible mécanisme d’action original, nous pouvons mener des travaux pour identifier le mode d’action du candidat et de ses cibles potentielles.
Découvrez ici nos technologies OMICS et Bioassays & Microsystems. Pour en savoir plus sur notre offre de modèles in vitro/in vivo c’est ici.
Identifier les cibles ou les voies impliquées dans le mécanisme d’action d’un candidat antimicrobien
L’identification des cibles ou des voies impliquées dans le mécanisme d’action de votre candidat antibiotique sont explorées à un stade précoce du développement, par notre approche multiomique associée à des analyses bioinformatiques et biostatistiques (Multi-OMICS-MoA). La résistance est étudiée à l’aide de tests classiques tels que les passages successifs sur des milieux contenant des concentrations croissantes en antibiotiques. Les mécanismes moléculaires de la résistance sont également évalués grâce à des technologies telles que le TnSeq (Transposon-Sequencing), ou en utilisant des souches KO ou KI des gènes de résistance.
Nous avons également développé une stratégie d’empreinte basée sur la RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) et la MS (spectrométrie de masse) pour différencier rapidement le mode d’action de votre antimicrobien par rapport à des composés connus. Nous déployons des stratégies d’interactomique permettant l’identification et la caractérisation moléculaire des interactions cellule/cellule, cellule/protéine, protéine/protéine.
Identification des signatures moléculaires de la résolution de l’infection et de l’efficacité du traitement
Afin de limiter le risque de résistance aux antimicrobiens (AMR) ou de toxicité dans le contexte d’infections latentes/persistantes, nous sommes en mesure d’identifier les signatures moléculaires les plus pertinentes pour surveiller efficacement la réponse à votre traitement médicamenteux. Nous mettons en œuvre une approche intégrée combinant :
- des technologies OMICs rationalisées, ciblées et non ciblées,
- et une expertise bioinformatique avancée.
Cette approche permet de distinguer les répondeurs précoces, tardifs et les non-répondeurs à votre médicament candidat.
Pour en savoir plus sur notre étude de cas ISIT-TB, cliquez ici.
Impact de votre solution antimicrobienne sur la réponse de l’hôte consécutive à une infection
Nous mesurons l’impact immunologique de votre produit sur la réponse de l’hôte lors de la propagation de l’infection, pendant sa phase de réduction, et en phase de récupération, par une caractérisation cellulaire et moléculaire (mobilisation de cytokines, production d’anticorps neutralisants…). Ce monitoring immunologique dans le temps peut être réalisé, qualitativement et quantitativement, dans le sang périphérique ou les tissus.
Grâce à une adaptation des modèles précliniques habituels à des souris immunocompétentes, on peut évaluer l’efficacité des immunomodulateurs ainsi que des approches alternatives comme les inhibiteurs de facteurs de virulence ou des phages.
Prédiction précoce de l’activité d’une solution thérapeutique
Pour prédire précocement l’activité de votre nouveau candidat, nous mettons en œuvre des tests in vitro ou ex vivo qui incluent ou reconstituent les composants biologiques et immunologiques impliqués dans les interactions hôte-pathogène-médicament. En complément des tests de référence (CMI, CMB, mesure du temps pour tuer, ICIF, résistance croisée, ), nous pouvons également combiner :
- des résultats obtenus à partir de tests réalisés sur des échantillons cliniques tels que l’urine, le sang, les expectorations, les biopsies,
- l’application d’une solution validée d’organe sur puce (sang, poumon, mais aussi biofilm),
- le développement et la mise en œuvre d’une technologie propriétaire d’analyse sur une seule cellule.
Voir notre technologie de microbiologie et d’ingénierie moléculaire.
Activité et efficacité des médicaments sur les biofilms
La formation de biofilms au cours d’une infection nécessite de nouveaux traitements, de nouvelles méthodes de prévention et de tests diagnostic. Pour évaluer ces solutions, nous avons développé une plateforme dédiée à l’étude des produits anti-biofilm. Pour en savoir plus sur notre technologie de microbiologie et d’ingénierie moléculaire, cliquez ici.
En complément des tests classiques en microplaques, nous déployons une technologie propriétaire, pour produire des biofilms de haute qualité qui permettent une évaluation reproductible de vos produits anti-biofilm. L’activité anti-biofilm de votre traitement est mesurée à l’aide de tests éprouvés.
Nous pouvons également mesurer l’activité de vos produits in vivo en utilisant un modèle de biofilm dynamique. En outre, nous avons un projet ambitieux visant à développer un système de biofilm sur puce. Enfin, nous pouvons évaluer l’efficacité in vivo de votre produit en utilisant des modèles précliniques adaptés au biofilm (greffe de biofilms ou formation stimulée) sur des surfaces abiotiques (comme les cathéters) ou biotiques (ulcères cutanés, plaies).
Découvrez notre offre de modèles in vitro/in vivo ici.
Déterminer le profil de vos pré-candidats (leads) ou candidats antimicrobiens
Afin de vous aider à sélectionner des pré-candidats et avant de mener les études d’efficacité in vivo, nous proposons d’évaluer votre produit in vitro sur des bactéries cultivées dans des milieux alternatifs imitant les conditions in vivo. Dans ces milieux, tous les systèmes de survie des bactéries sont stimulés, ce qui rend l’évaluation plus facilement transposable in vivo. Certains de ces systèmes biomimétiques sont couplés à des puces microfluidiques, afin de disposer d’un environnement dynamique encore plus pertinent dans lequel nous pouvons évaluer plus en avant les interactions entre l’hôte, le pathogène et le médicament.
Pour mieux évaluer vos candidats avant la phase de preuve de concept clinique, nous avons la capacité de mesurer le profil de sensibilité de votre antimicrobien sur des collections de souches cliniques recueillies dans le cadre d’études non-interventionnelles auprès de notre réseau hospitalo-universitaire.
Efficacité de votre antimicrobien sur des modèles précliniques éprouvés et personnalisés
En amont de l’évaluation de l’efficacité, nous proposons d’étudier la biodistribution et la pharmacocinétique de votre produit, afin d’optimiser le schéma thérapeutique.
Nos modèles précliniques infectieux sont adaptés à votre produit et à son domaine d’application. Nous disposons de divers modèles dont, notamment, des modèles de pneumonie, de septicémie, d’infection urinaire, d’infections de la peau et des tissus mous… Pour la preuve de concept in vivo, nous avons également développé des solutions d’imagerie préclinique pour mener des études longitudinales d’efficacité. Pour cela, nous disposition d’une collection unique de bactéries bioluminescentes issues de la liste ESKAPE.
Veuillez consulter notre technologie de modèles et d’imagerie précliniques ici.
Pour ne savoir plus sur nos Modèles in vitro/in vivo voir ici.
Identifier les cibles ou les voies impliquées dans le mécanisme d’action d’un candidat antimicrobien
L’identification des cibles ou des voies impliquées dans le mécanisme d’action de votre candidat antibiotique sont explorées à un stade précoce du développement, par notre approche multiomique associée à des analyses bioinformatiques et biostatistiques (Multi-OMICS-MoA). La résistance est étudiée à l’aide de tests classiques tels que les passages successifs sur des milieux contenant des concentrations croissantes en antibiotiques. Les mécanismes moléculaires de la résistance sont également évalués grâce à des technologies telles que le TnSeq (Transposon-Sequencing), ou en utilisant des souches KO ou KI des gènes de résistance.
Nous avons également développé une stratégie d’empreinte basée sur la RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) et la MS (spectrométrie de masse) pour différencier rapidement le mode d’action de votre antimicrobien par rapport à des composés connus. Nous déployons des stratégies d’interactomique permettant l’identification et la caractérisation moléculaire des interactions cellule/cellule, cellule/protéine, protéine/protéine.
Impact de votre solution antimicrobienne sur la réponse de l’hôte consécutive à une infection
Nous mesurons l’impact immunologique de votre produit sur la réponse de l’hôte lors de la propagation de l’infection, pendant sa phase de réduction, et en phase de récupération, par une caractérisation cellulaire et moléculaire (mobilisation de cytokines, production d’anticorps neutralisants…). Ce monitoring immunologique dans le temps peut être réalisé, qualitativement et quantitativement, dans le sang périphérique ou les tissus.
Grâce à une adaptation des modèles précliniques habituels à des souris immunocompétentes, on peut évaluer l’efficacité des immunomodulateurs ainsi que des approches alternatives comme les inhibiteurs de facteurs de virulence ou des phages.
Activité et efficacité des médicaments sur les biofilms
La formation de biofilms au cours d’une infection nécessite de nouveaux traitements, de nouvelles méthodes de prévention et de tests diagnostic. Pour évaluer ces solutions, nous avons développé une plateforme dédiée à l’étude des produits anti-biofilm. Pour en savoir plus sur notre technologie de microbiologie et d’ingénierie moléculaire, cliquez ici.
En complément des tests classiques en microplaques, nous déployons une technologie propriétaire, pour produire des biofilms de haute qualité qui permettent une évaluation reproductible de vos produits anti-biofilm. L’activité anti-biofilm de votre traitement est mesurée à l’aide de tests éprouvés.
Nous pouvons également mesurer l’activité de vos produits in vivo en utilisant un modèle de biofilm dynamique. En outre, nous avons un projet ambitieux visant à développer un système de biofilm sur puce. Enfin, nous pouvons évaluer l’efficacité in vivo de votre produit en utilisant des modèles précliniques adaptés au biofilm (greffe de biofilms ou formation stimulée) sur des surfaces abiotiques (comme les cathéters) ou biotiques (ulcères cutanés, plaies).
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Efficacité de votre antimicrobien sur des modèles précliniques éprouvés et personnalisés
En amont de l’évaluation de l’efficacité, nous proposons d’étudier la biodistribution et la pharmacocinétique de votre produit, afin d’optimiser le schéma thérapeutique.
Nos modèles précliniques infectieux sont adaptés à votre produit et à son domaine d’application. Nous disposons de divers modèles dont, notamment, des modèles de pneumonie, de septicémie, d’infection urinaire, d’infections de la peau et des tissus mous… Pour la preuve de concept in vivo, nous avons également développé des solutions d’imagerie préclinique pour mener des études longitudinales d’efficacité. Pour cela, nous disposition d’une collection unique de bactéries bioluminescentes issues de la liste ESKAPE.
Veuillez consulter notre technologie de modèles et d’imagerie précliniques ici.
Pour ne savoir plus sur nos Modèles in vitro/in vivo voir ici.