Micro-organismes – Echantillons d’intérêt

Accès aux micro-organismes par différents moyens

Isolement, identification et caractérisation des micro-organismes

Biobanque et gestion des données

Explorer la relation hôte-microorganisme

Micro-organismes – Echantillons d’intérêt

Accès à des échantillons biologiques bien caractérisés et documentés pour explorer les interactions hôte-pathogène

Notre objectif est de fournir des micro-organismes, des échantillons précliniques et cliniques caractérisés et documentés pour soutenir vos recherches en sciences de la vie et en biotechnologie.

Ces échantillons biologiques peuvent faire partie de notre propre biobanque ou être collectés dans le cadre d’études précliniques ou cliniques prospectives afin de générer des innovations technologiques et des résultats scientifiques fiables.

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Accès aux micro-organismes et aux échantillons (pré)cliniques par différents moyens

Pour stimuler l’innovation et répondre aux besoins des patients, nous donnons accès à du matériel biologique de haute qualité :

Réglementation
Nous possédons une solide expertise en matière d’exigences réglementaires concernant les échantillons humains et avons établi un réseau clinique mondial solide dans le domaine des maladies infectieuses. Nous favorisons la mise en œuvre et agissons en tant que coordinateur d’études cliniques prospectives interventionnelles et non interventionnelles (hors produits de santé) pour collecter des échantillons adaptés aux critères de sélection des patients, aux méthodes d’échantillonnage et aux spécifications des contraintes de stockage.

Découvrez ici notre technologie d’Opérations Cliniques.

Les échantillons du dépôt biologique de BIOASTER comprennent :

  • ­des espèces d’isolats cliniques qui sont identifiées sur la liste prioritaire des pathogènes de l’OMS, notamment Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa et Enterobacteriaceae,
  • ­des micro-organismes (bactéries et virus) isolés à partir de spécimens cliniques collectés tout au long de nos études rétrospectives ou prospectives à partir de différentes matrices biologiques (Urine, hémocultures, LBA, selles) mais aussi à partir de dispositifs médicaux (cathéter, prothèse…) et sont caractérisés pour leur sensibilité aux antibiotiques,
  • des micro-organismes bactériens bioluminescents ou fluorescents transformés en interne,,
  • a une variété de souches bactériennes commensales isolées à partir d’échantillons fécaux prélevés sur des volontaires sains et identifiées par séquençage partiel du gène codant pour l’ARNr 16S.

Dépôts au sein du réseau BIOASTER
En fonction de vos besoins, nous sommes en mesure de rechercher des échantillons existants pertinents parmi les biobanques et les biodépôts de notre réseau international. Notre équipe s’occupe des procédures réglementaires, y compris l’autorisation d’importation des échantillons.

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Isolement, identification et caractérisation des micro-organismes

Nous fournissons des solutions de bout en bout pour caractériser un micro-organisme, y compris :

  • la sélection et l’isolement des microbes à partir d’une matrice biologique complexe,
  • la culture de micro-organismes dans un environnement contrôlé par l’O2 (conditions aérobies ou anaérobies) en utilisant des milieux personnalisés et spécifiques dans des laboratoires de biosécurité BSL2 et BSL3,
  • l’identification microbienne par analyse biochimique et moléculaire en utilisant le gène 16S ou le séquençage du génome complet,
  • le phénotypage et évaluation des facteurs de virulence
  • l’évaluation de la sensibilité/résistance aux antibiotiques.

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Biobanques et gestion des données

Nous proposons un stockage à court et à long terme du matériel biologique de grande valeur collecté dans le cadre de nos projets afin de rendre possible des recherches futures, dans le respect des principes éthiques, des contraintes réglementaires et légales. Nos collections sont reliées à des bases de données sécurisées et fiables associant des informations cliniques et un ensemble de données biologiques. Nous fournissons une solution efficace de suivi des échantillons grâce à notre système de gestion des informations de laboratoire (LIMS), dans un environnement de haute qualité conforme à la norme ISO9001.

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Explorer les interactions hôte-microorganisme

Les interactions hôte-pathogène ou microbiome sont essentielles à la compréhension des maladies infectieuses et de la manière dont ces interactions peuvent être exploitées pour de nouveaux traitements et préventions. Cela implique l’investigation et l’analyse des différentes étapes de l’infection, l’exploration des mécanismes d’infection des pathogènes..

    Voici quelques solutions que nous pouvons appliquer dans le cadre du développement de vos nouveaux médicaments, vaccins et autres thérapeutiques :
  • Impliquer une collection unique de bactéries bioluminescentes/fluorescentes ESKAPE dans des modèles précliniques qui récapitulent les principales caractéristiques de l’infection clinique (en ce qui concerne le tropisme des agents pathogènes et la voie d’infection).
  • ­Séquençage de nouvelle génération pour déterminer si le microbiome de l’hôte influe sur l’immunité, l’efficacité du vaccin ou la réponse au traitement, ainsi que pour étudier les effets de l’expression des gènes de l’agent pathogène et de l’hôte et la manière dont cela influence la réponse de l’hôte à une maladie ou à un traitement.

  • Caractérisation ­in vivo surveillance longitudinale des interactions hôte-pathogène (c’est-à-dire : physiopathologie des infections et réponse immunitaire de l’hôte) à l’aide de systèmes d’imagerie pour petits animaux tels que la tomographie assistée par ordinateur.
  • ­Analyses tissulaires ex vivo par le biais d’une histopathologie avancée combinée aux CIMO (c.-à-d. : protéines/métabolites).
  • ­Des approches ciblées aux approches multi-omiques pour effectuer une analyse fonctionnelle de l’hôte, du pathogène/microbiote et corréler les résultats à la réponse de l’hôte.
  • ­Évaluation des effets immunodulatoires in vivo grâce à des solutions intégrées d’OMIC et d’immunomonitoring à haut contenu.
  • ­Cellular and molecular characterization of the host immune response during infection.
  • ­Caractérisation des réponses cellulaires spécifiques et de la réponse immunitaire protectrice après l’infection.
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