Au cours des deux dernières décennies, les nouvelles technologies ont permis aux chercheurs d’évaluer la composition des microbiomes et leurs rôles potentiels.
Ainsi, les technologies modernes ont vu le jour ouvrant à une nouvelle ère d’opportunités pour l’exploitation du microbiote comme nouvelle source de solutions diagnostiques, prophylactiques ou thérapeutiques.
Alors que vous cherchez à évaluer de telles opportunités, nous nous engageons à soutenir vos programmes de R&D en utilisant notre approche intégrée, qui réunit les méthodes de test et l’expertise appropriées.
Nous combinons des technologies cellulaires et moléculaires avec des modèles précliniques in vitro et in vivo pour permettre une exploration approfondie des microbiomes et vous aider à comprendre et à exploiter la fonctionnalité des microbiomes.
Accéder aux informations clés pour exploiter le microbiome
- Explorer
Pour vous permettre d’explorer les possibilités étendues qu’offrent les microbiomes, nous vous aidons à concevoir une approche intégrée, en analysant la composition taxonomique des micro-organismes présents et les capacités fonctionnelles des communautés microbiennes. Nous combinons nos capacités multi-omiques, les outils de biologie synthétique, tels que les jumeaux numériques, pour assurer une compréhension plus approfondie de ces écosystèmes complexes et de la façon dont ils réagissent aux changements environnementaux.
En savoir plus sur nos technologies OMICS et xDATA.
Si vous souhaitez mieux comprendre la dynamique des sous-populations, elles peuvent être explorées au niveau cellulaire à l’aide de la cytométrie en flux et d’un panel de marqueurs ciblant divers critères phénotypiques.
- Isoler
Pour approfondir la connaissance des microbiomes centrée sur le génome ou la population cellulaire, nous pouvons vous fournir des biospécimens issus d’essais clinique, à partir desquels nous pouvons égalemement isoler et de cultiver des souches microbiennes dérivées d’échantillons complexes. Vous trouverez des informations plus détaillées sur notre page dédiée aux Opérations cliniques. En outre, notre approche « culturomique ciblée » peut vous aider à accéder à la plupart des bactéries commensales, même si elles sont très sensibles à l’oxygène ou peu abondantes dans les échantillons.
Voir ici l’étude de cas Ysopia.
- Cultiver
Si vous souhaitez obtenir une biomasse suffisante pour caractériser plus avant les bactéries isolées, nous pouvons vous aider à optimiser les conditions de culture des bactéries anaérobies, de l’échelle de quelques millilitres aux systèmes de fermentation sur paillasse. Notre expertise peut être appliquée à la caractérisation de divers micro-organismes, comme les probiotiques ou les micro-organismes utilisés pour la fermentation industrielle.
Pour en savoir plus, consultez notre étude de cas FAME-Maat Pharma.
Interactions hôte-microbiome
Comprendre et exploiter les microbiomes
Si vous êtes un acteur dans le domaine de la thérapeutique, de la nutrition ou des cosmétiques, les microbiomes peuvent être à la fois des sources de produits très innovants et des cibles d’intérêt. Nous pouvons vous aider à identifier de nouveaux candidats pour le développement de produits et/ou à évaluer les interactions possibles entre votre produit, les microbiomes et leurs hôtes pour des applications en santé humaine et vétérinaire.
À l’aide de modèles précliniques in vitro et in vivo, tels que les souris gnotobiotiques (lire notre offre Modèles in vitro/in vivo et l’étude de cas GM15), nous pouvons vous aider à déterminer les mécanismes d’interaction et le mode d’action possible de vos produits dans le cadre d’approches axées sur les microbiomes.
Quelle que soit l’approche que vous souhaitez mettre en œuvre, nous pouvons vous aider à déterminer les interactions hôte-produit-microbiome, impliquant :
- des molécules et des ingrédients, éventuellement dérivés de microorganismes, qui favorisent la croissance des microbes d’intérêt : petites molécules, aliments fermentés, postbiotiques, prébiotiques,
- dicro-organismes entiers : produits biothérapeutiques vivants (LBP), probiotiques, greffes de microbiote fécal, micro-organismes inactivés, et éventuellement des OGM.
Ces connaissances ouvrent de nombreuses voies d’applications potentielles dans la recherche d’antimicrobiens , comme l’utilisation possibles de bactériocines, de métabolites de micro-organismes, de phages et de protéines dérivées de phages pour cibler les micro-organismes pathogènes. Elles permettent également de mettre au point des moyens d’inactivation sélectives de micro-organismes pathogènes sans affecter le reste du microbiome.
En consultant ici notre programme Antimicrobien vous en saurez plus sur notre capacité à vous accompagner dans le développement de vos solutions antimicrobiennes.
Microbiomes et biomarqueurs/ test diagnostics ou compagnons
Alors que de plus en plus de données montrent un lien de causalité entre les communautés microbiennes dysbiotiques et les pathologies, les diagnostics basés sur le microbiome deviennent des outils qui permettent de détecter et/ou de faire des pronostics sur les maladies humaines à l’aide de signatures microbiennes. De même, les biomarqueurs issus du microbiome peuvent contribuer à améliorer le taux de succès développement de médicaments ouvrant la voie à des traitements individualisés basés sur des preuves cliniques et biologiques, en particulier dans diverses maladies telles que les infections, le cancer, les troubles inflammatoires et métaboliques.
Nous pouvons vous aider à identifier et à valider des biomarqueurs ou des signatures pour mettre au point un test compagnon, de diagnostic ou un indicateur biologique de substitution pré-clinique ou clinique et l’adapter à son utilisation finale, au laboratoire, à l’hôpital ou en tests rapides au chevet du patient. En particulier, notre approche intégrée, met en œuvre les méthodes « omiques » adaptées et validées pour l’étude du microbiote intestinal, mais aussi du microbiote cutané ou d’autres microbiotes.
En consultant ici notre page dédiée aux Biomarqueurs, vous en saurez plus sur notre capacité à vous accompagner dans le développement de biomarqueurs issus du microbiome.
Interactions hôte-microbiome
Comprendre et exploiter les microbiomes
Si vous êtes un acteur dans le domaine de la thérapeutique, de la nutrition ou des cosmétiques, les microbiomes peuvent être à la fois des sources de produits très innovants et des cibles d’intérêt. Nous pouvons vous aider à identifier de nouveaux candidats pour le développement de produits et/ou à évaluer les interactions possibles entre votre produit, les microbiomes et leurs hôtes pour des applications en santé humaine et vétérinaire.
À l’aide de modèles précliniques in vitro et in vivo, tels que les souris gnotobiotiques (lire notre offre Modèles in vitro/in vivo et l’étude de cas GM15), nous pouvons vous aider à déterminer les mécanismes d’interaction et le mode d’action possible de vos produits dans le cadre d’approches axées sur les microbiomes.
Quelle que soit l’approche que vous souhaitez mettre en œuvre, nous pouvons vous aider à déterminer les interactions hôte-produit-microbiome, impliquant :
- des molécules et des ingrédients, éventuellement dérivés de microorganismes, qui favorisent la croissance des microbes d’intérêt : petites molécules, aliments fermentés, postbiotiques, prébiotiques,
- dicro-organismes entiers : produits biothérapeutiques vivants (LBP), probiotiques, greffes de microbiote fécal, micro-organismes inactivés, et éventuellement des OGM.
Ces connaissances ouvrent de nombreuses voies d’applications potentielles dans la recherche d’antimicrobiens , comme l’utilisation possibles de bactériocines, de métabolites de micro-organismes, de phages et de protéines dérivées de phages pour cibler les micro-organismes pathogènes. Elles permettent également de mettre au point des moyens d’inactivation sélectives de micro-organismes pathogènes sans affecter le reste du microbiome.
En consultant ici notre programme Antimicrobien vous en saurez plus sur notre capacité à vous accompagner dans le développement de vos solutions antimicrobiennes.
Zoom : Le réseau Cynbiome®
Au-delà de ces frontières, BIOASTER est partenaire du réseau Cynbiome®. Ce réseau d’excellence sur le microbiote capitalise sur la richesse et la complémentarité d’acteurs spécialisés pour l’investigation préclinique du microbiome.
Cynbiome® vise un double objectif :
- proposer une offre préclinique unique de services individuels ou intégrés dans le domaine du microbiome et des maladies infectieuses,
- réaliser des activités de R&D pour développer des modèles précliniques innovants, notamment le modèle du primate non humain (PNH) et des outils analytiques pertinents, à travers des projets de R&D collaboratifs.
Pour en savoir plus sur les partenaires du réseaux et Cynbiome® : Cynbiome – 1 st excellence network on microbiota and infectious diseases
Références
