Notre mission est de développer des connaissances, des savoir-faire et des technologies pour connaitre, comprendre et analyser les interactions entre hôte/pathogène/solution thérapeutique et contribuer ainsi à lutter contre l’émergence de nouvelles pathologies infectieuses et la résistance aux antimicrobiens (ou AMR en anglais).
En qualité de développeur des solutions thérapeutiques curatives ou préventives, les principaux défis auxquels vous êtes confrontés sont de différents ordres :
- construire une démarche de développement globale et coordonnée,
- développer des traitements qui ciblent des pathogènes prioritaires connus ou émergents,
- proposer des stratégies alternatives (anticorps, peptides, phages, etc.),
- trouver des approches complémentaires pour limiter les résistances ou la persistance des bactéries.
Nos domaines d’expertises couvrent les principales maladies infectieuses, à savoir les infections nosocomiales, les maladies tropicales négligées et les pandémies.
Les agents pathogènes que nous manipulons couramment dans un environnement BSL2 ou BSL3 sont ceux qui figurent sur les listes prioritaires de l’OMS, des autorités sanitaires et des centres de contrôle des maladies infectieuses. Ils peuvent être intra ou extracellulaires, avoir un comportement indépendant (planctonique) ou organisé (biofilm) et se multiplier rapidement ou être dormants.
Les solutions que vous souhaitez développer, à des fins thérapeutiques ou prophylactiques, peuvent être dirigées contre l’agent pathogène ou spécifiques à l’hôte (récepteurs spécifiques à la surface des cellules, réponse immunitaire ou microbiote).
Nous contribuons à vos enjeux dans les phases de découverte et de développement en vous proposant une approche globale et coordonnée allant des méthodes alternatives d’identification de cibles, de sélection des pré-candidats (leads), aux évaluations du potentiel thérapeutique de vos candidats seuls ou en combinaison.
Si nécessaire, nous adaptons des modèles et des tests classiques ou nous en développons de nouveaux pour offrir les solutions qui répondent au mieux à vos besoins spécifiques. Par exemple, dans le contexte de la phagothérapie, nous avons adapté des méthodologies classiques de bio-distribution et de pharmacocinétique pour étudier in vivo l’évolution de la concentration de phages dans différents organes après injection IV.
- nosocomiales, bactériennes ou fongiques, généralement responsables d'infections des voies respiratoires, des voies urinaires, du sang ou de la peau
- émergentes, virales ou parasitaires, généralement responsables d'épidémies, de pandémies ou de maladies tropicales négligées
- virus (ex. : SARS-COV-2, dengue, HBV, chikungunya)
- bactéries (ex. : ESKAPE, Clostridium difficile, Mycobacterium tuberculosis, bactéries résistantes aux antibiotiques (AMR)
- parasites (ex. : Trypanosoma cruzi, Leishmania donovani, Plasmodium spp.)
- champignons (Candida albicans, Candida auris, Aspergillus fumigatus)
- petite molécule, seule ou en combinaison
- macromolécules (peptide, protéines, anticorps, nucléotides)
- extraits et produits naturels
- solutions thérapeutiques alternatives telles que les bactériophages
- thérapies orientées vers l'hôte (immunomodulateur, etc.)
- voies respiratoires, pneumonie (y compris nosocomiales avec/sans ventilation assistée), COVID, grippe
- voies urinaires, infections urinaires, pyélonéphrite
- circulation sanguine, bactériémie, septicémie
- peau et tissus mous, plaies
Identification de hits et sélection de leads
Afin de générer des nouveaux antibiotiques issus de bio-ressources anaérobiques, nous développons de nouvelles méthodes de criblage, basées sur la micro-fluidique afin d’identifier de nouvelles bactéries productrices d’antibiotiques.
Notre capacité à cultiver ces bactéries fastidieuses d’intérêt en quantité suffisante nous permet d’analyser la structure du composé antibiotique par HPLC, SM, RMN. Après identification du processus de biosynthèse de l’antibiotique par la bactérie anaérobique et transfert de ce processus par ingénierie de souches, nous pourrons vous fournir une souche facilement cultivable capable de produire le nouvel antibiotique identifié.
Regardez notre vidéo Anoxic ici.
L’évaluation in vitro de l’activité de vos composés sur des souches cliniques ou modèles selon les recommandations du CLSI ou de l’EUCAST, sous forme planctonique ou biofilm, vous permettra de mesurer leur susceptibilité et résistance dans un panel étendu de conditions différentes.
Optimisation de leads
Ce premier niveau de caractérisation fait appel aux modèles in vitro avancés, dont le design expérimental (in vivo mimicking media, organ-on-chip, environnement dynamique) est plus représentatif de l’in vivo. Il s’agit en particulier de vous permettre de dérisquer votre produit dans les phases précliniques précoces.
L’identification de nouvelles cibles et des voies biologiques impliquées dans l’activité d’un antibiotique, ainsi que la démonstration de la nouveauté d’un mécanisme d’action, sont rendues possibles par un ensemble de technologies OMIC, bio-informatique et d’intelligence artificielle intégrées.
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Caractérisation de candidat médicament
En préambule des études in vivo, nous vous proposons de réaliser des études de biodistribution et évaluations de profils pharmacocinétiques afin de déterminer le régime thérapeutique optimal (voie d’administration, dose, nombre de doses et intervalle entre les doses). Nous pourrons ensuite évaluer l’efficacité de votre candidat, seul ou en combinaison. Enfin, les études des relations PK/PD en fonction des différentes voies d’administration peuvent compléter avantageusement l’évaluation de votre candidat médicament.
Nous personnalisons nos modèles précliniques de maladies infectieuses chez les rongeurs aux spécificités de votre produit avant d’en tester l’efficacité (résistance du pathogène, statut immunitaire, sévérité de l’infection, chronicité, readouts, etc.). Ces modèles sur mesure concernent en particulier, la septicémie, la pneumonie, les infections urinaire, les infections de la peau et des tissus mous, les abcès et les infections du cœur.
Ils nous permettent également de rechercher des biomarqueurs d’efficacité de traitements, au cours de ces études.
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Ensemble, nous sélectionnons les données qui seront utilisées dans l’étude, parmi plusieurs paramètres : cliniques (survie, poids, température, etc.), microbiologiques (UFC, UFP, imagerie in vivo, etc.), immunologiques (recrutement de PBMC, dosage de cytokines, anticorps neutralisants, etc. Par exemple, notre modèle préclinique COVID-19 est hautement personnalisable pour s’adapter aux spécificités de vos produits.
Dans le cadre des thérapies orientées de l’hôte,
nous proposons de:
- caractériser la réponse immunitaire au cours d’un traitement antimicrobien pour affiner le régime thérapeutique,
- étudier la modulation de la réponse immunitaire par votre produit seul ou en combinaison,
- quantifier la réponse immunitaire pour comparer des molécules sur la base de ces analyses.
Références
